張家港市疾病預防控制中心于2002年1月8日成立，另對外掛牌張家港市衛生檢測中心。是集突發公共衛生事件應急處置、疾病預防與控制、健康危害因素監測控制等職能為一體的綜合性疾病預防控制機構。 中心現有正式職工101名，其中衛技人員81名，占職工總數的80％，高級衛技人員11名，中級28名，占衛技人員總數的48%，形成了較為合理的專業技術人員隊伍結構。2003年新建疾控衛生檢測大樓，建筑面積達7500平方米。實驗室建有整體萬級的凈化實驗室和艾滋病初篩實驗室等，配置了全自動生化分析儀、高效液相色譜儀、氣相色譜儀、離子色譜儀等一批精密儀器設備。
威海市疾病預防控制中心于2001年更名成立，為正處級全額事業單位。編制65人，實有61人。有專業技術人員45人，其中博、碩士研究生15人、本科25人；副高級以上職稱16人、中級職稱26人。內設辦公室、應急辦公室、綜合科、傳染病防制科、疫情與信息管理科、結核病（艾滋病）防制科、環境衛生科、食品衛生科、消毒與有害生物防制科、慢性病與地方病防制科、免疫規劃科、檢驗科、質量管理辦公室、健康促進中心等14個科室。
晉江市疾病預防控制中心是2005年4月經晉江市人民政府批準設立的公益性全額撥款的事業單位，前身為晉江市衛生防疫站。
泰州市疾病預防控制中心系泰州市政府于2002年10月對原泰州市衛生防疫站、健康教育所等單位進行撤并后組建而成，是在市衛生計生委領導下的副處級全民事業單位。
蘇州市疾病預防控制中心（以下簡稱疾控中心）是由蘇州市政府舉辦的、直屬于蘇州市衛生局領導的、業務上接受江蘇省疾病預防控制中心指導的、在轄區內實施疾病預防控制與公共衛生技術服務的行政管理類事業單位。
上海市嘉定區疾病預防控制中心，位于：上海市市轄區嘉定區上海市嘉定區塔城路264號，交通方便，歡迎上級領導蒞臨指導，社會各界共同監督，本鄉鎮財務已按國家規定進行公開，如欲了解詳情，請和我們聯系，為了更好的服務公眾，上海市嘉定區疾病預防控制中心已開通微博。新聞媒體采訪請事先與上級宣傳單位聯系。隨著改革開放以來，經濟發展迅速，我單位積極響應號召，堅持以民為主，大力促進經濟發展，振興市場。
昆山市疾病預防控制中心（增掛昆山市衛生檢測中心）成立于2001年，是昆山市人民政府舉辦、昆山市衛生和計劃生育委員會下設副科級事業單位，為全市疾病預防控制與公共衛生技術指導中心。
武漢市疾病預防控制中心（以下簡稱“中心”）于2002年12月正式掛牌成立，其前身為武漢市衛生防疫站，始建立于1952年9月。中心是履行政府職能的專門機構，是全市疾病預防控制業務技術管理與指導的中心，屬Ⅰ類公益性衛生事業單位。
南通市疾病預防控制中心是2002年10月在原南通市衛生防疫站、市皮膚病防治所、市健康教育所三個獨立法人單位基礎上撤并組建的社會公益型事業單位，承擔全市760萬人口的衛生防病任務。
蘇州工業園區疾病防治中心（簡稱園區疾防中心），英文名Suzhou Industrial Park Center for Disease Control and Prevention,縮寫SIPCDC。園區疾防中心是1999年5月經蘇園工[1999]25號文件批準成立的國有企業，注冊資金500萬元，同時增掛園區體檢中心、衛生防疫站、計劃生育技術指導站牌子。主要承擔園區疾病預防控制、婦幼保健、健康體檢、檢驗檢測、計劃生育等公共衛生服務、指導職能。
煙臺市疾控中心是2006年12月在原煙臺市衛生防疫站、市衛生檢疫站基礎上合并組建而成的全額撥款正處級事業單位。中心位于萊山區府后路17號，占地面積20畝，建筑面積1.33萬㎡，其中實驗室用房3500㎡，總投資4100萬元。編制為194人，設有22個科室。現有177人，其中專業技術人員158人，專業技術人員中，具有高級技術職稱的57人，中級技術職稱的73人。
深圳市寶安區疾病預防控制中心（簡稱疾控中心）是在原寶安區衛生防疫站改制后新成立的衛生事業單位，疾控中心包含寶安區衛生檢驗中心，為二塊牌子一套人馬。 該中心是全區集疾病預防與控制，衛生監測與檢驗，健康教育與促進等公共衛生技術服務為一體的新型機構。現設公共衛生科、傳染病與流行病科、計劃免疫科、健康檢查科、檢驗科和質量控制科業務科室和辦公室以及財務科等職能科室。中心現有121名職工其中有正高4人、副高17人、中級24人；大學本科以上學歷39人，其中博士2人、碩士6人、大中專68人,是一個職稱與學歷結構較為合理的綜合實力較強的衛生技術服務單位。
東莞市疾病預防控制中心是上級部門的大力支持和指導下，在原東莞市衛生防疫站的基礎上于2002年12月重新組建的副處級事業單位，增掛東莞市衛生檢驗中心牌子。本中心是東莞市疾病預防控制、衛生檢驗的公益性機構。
重慶市疾病預防控制中心成立于2000年11月，前身是重慶市衛生防疫站，是從事基本公共衛生服務的公益性事業單位。增掛了重慶市救災防病應急處理中心、三峽疾病監測中心、國家食品安全監測重慶中心牌子。
?上海市疾控中心擁有具有一流設備、一流管理水平的衛生檢測實驗室、微生物實驗室和毒理室、公共衛生分子生物學研究室以及艾滋病研究中心所屬實驗室，為疾病預防控制、監測、科研和健康評價提供實驗檢測依據，承擔突發公共衛生事件發生原因的應急檢測和鑒定，同時為適應預防醫學發展以及提高應對突發公共衛生事件處置能力的需要，開展相關領域的實驗方法研究和技術儲備。目前，中心經計量認證批準的檢驗項目為1047項，經國家實驗室認可通過的檢驗項目為1047項。
